作为化肥的替代品，有机肥与生物菌肥是有机农业和绿色农业的基础之一，由于两者各有不足，目前已经出现并迅速推广一种兼有两者优点的肥料——生物菌腐殖酸有机肥。 
1 瓦力生物菌腐殖酸有机肥与化肥相比：
1） 瓦力生物菌腐殖酸有机肥营养元素齐全；化肥营养元素只有一种或几种。
2） 瓦力生物菌腐殖酸有机肥能够改良土壤；化肥经常使用会造成土壤板结。
3） 瓦力生物菌腐殖酸有机肥能提高产品品质；化肥施用过多导致产品品质低劣。
4） 生物生物菌腐殖酸有机肥能改善作物根际微生物群，提高植物的抗病虫能力；化肥则是作物微生物群体单一，易发生病虫害。
5） 生物生物菌腐殖酸有机肥能促进化肥的利用，提高化肥利用率；化肥单独使用易造成养分的固定和流失。
2 瓦力生物菌腐殖酸有机肥与精制有机肥相比：
　　精制有机肥是畜禽粪便经过烘干、粉碎后包装出售的商品有机肥。
1）瓦力生物菌腐殖酸有机肥完全腐熟，不烧根，不烂苗；精制有机肥未经腐熟，直接使用后在土壤里腐熟，会引起烧苗现象。
2）瓦力生物菌腐殖酸有机肥经蚯蚓 消化和后期工艺制作，杀死病原菌和虫卵，减少病虫害发生；精制有机肥未经腐熟，在土壤中腐熟时会引来地下害虫。
3）瓦力生物菌腐殖酸有机肥中添加了有益菌，由于菌群的占位效应，减少病害发生；精制有机肥由于高温烘干，杀死了里面的全部微生物。
4）瓦力生物菌腐殖酸有机肥养分含量高；精制有机肥由于高温处理，造成了养分损失。
5）瓦力生物菌腐殖酸有机肥干净卫生、无异味；精制有机肥未经除臭，返潮即出现恶臭。
3 瓦力生物菌腐殖酸有机肥与农家肥（传统有机肥）的区别：
1）瓦力生物菌腐殖酸有机肥完全腐熟，不携带虫卵；农家肥堆放简单，虫卵死亡率低。
2）瓦力生物菌腐殖酸有机肥无臭；农家肥有恶臭。
3）瓦力生物菌腐殖酸有机肥施用方便，均匀；农家肥施用不方便，肥料施用不均匀。
4 瓦力生物菌腐殖酸有机肥与生物菌肥的区别： 
厂家一般把普通有机肥称为生物有机肥，生物有机肥叫做菌肥。这里要区别开来
1）瓦力生物菌腐殖酸有机肥含有功能菌和有机质，能改良土壤促进被土壤固定养分的释放；生物菌剂只含有功能菌，通过功能菌来促进土壤固定肥料的利用。 
2）瓦力生物菌腐殖酸有机肥的有机质本身就是功能菌生活的环境，施入土壤后容易存活；而生物菌剂的功能菌可能不适合有的土壤