马德里商标注册：
马德里商标 注册是马德里所有缔约国之间的一种商标 注册保护方式，它的特点就是只需要提交一份申请就可以要求在多个缔约国进行注册。 目前，共有95个缔约方。

欧盟商标注册：
欧盟商标注册是指通过欧盟下属的内部市场协调局在欧盟所有国家统一申请保护的注册方式。由于欧盟是一个统一的市场，所以商标获得“欧盟（也称欧共体）”注册后，将在欧盟各个成员国受到保护。

两者的保护范围
马德里商标：
受保护地域范围以申请人指定国家为限，可指定国家包括加入马德里议定书与马德里协定书的国家、地区，及相关区域性组织，目前共95个成员国。申请人可以指定1个国家，也可以指定全部的成员国，所以，商标的保护范围，是我们提交申请指定的国家。
欧盟商标：
欧盟包括了28个成员国，不管在这28个成员国之中注册哪个国家的商标，都将受到这28个国家的保护。
欧盟成员国：奥地利、法国、意大利、西班牙、德国、卢森堡、瑞典、丹麦、希腊、荷兰、英国、芬兰、爱尔兰、葡萄牙、匈牙利、波兰、捷克、斯洛文尼亚、斯洛伐克、爱沙尼亚、立陶宛、马耳他、塞浦路斯、拉脱维亚、保加利亚、罗马尼亚、克罗地亚。
申请人资格
欧盟商标：
没有限制，任何人都可以提交申请。
马德里商标：
申请人必须是成员国的企业实体、个人或其他组织，且必须以原属国已申请或注册商标为基础商标，向世界知识产权组织（WIPO）提起申请。就中国而言，申请人必须已经取得商标注册证书或者商标受理通知书，方能申请马德里商标。
注册风险性
欧盟商标：
欧盟商标注册是一个国家一个国家的申请注册，如果前边国家都注册成功了，最后一个国家没有通过，那么这个商标就是注册失败，不能在任何国家享受保护，因此欧盟国注册商标的风险性是很高的。
马德里商标：
如果选择了10个国家进行马德里商标注册，商标在其中9个国家注册成功，只有一个国家没有成功，那么这个商标在这9个国家受到保护，这样考虑，马德里商标注册的风险较欧盟商标注册低。
总结：
马德里商标和欧盟商标各有各的优势，如果企业只需要在欧盟成员国寻求商标权利的保护，建议选择申请欧盟商标，如果需要在更多的国家进行商标注册，通过马德里申请是非常不错的选择。