(1)种蛋采集 绝大多数雌鸵鸟在下午3-6时产蛋，个别产自上午或夜间。鸵鸟产蛋后要及时捡蛋，以减少破损和污染。雄鸵鸟有保护雌鸵鸟及鸟蛋的本能，捡时要2人配合，1人将鸟赶开，1人把蛋捡走。捡蛋时应将手洗净或戴手套，以免污染种蛋。对污染的种蛋用消毒湿毛巾擦干净。种蛋须登记，注明雌、雄种鸟号码和产蛋日期，并称重编号。 

　　(2)种蛋选择 合格的种蛋要求清洁，表面不应有泥土、粪便以及其他污物；其二要求大小适中，蛋重过大过小都会影响孵化率和雏鸟的质量，一般要求种蛋重1．5千克左右，超过2千克和小于1千克的种蛋一般应淘汰。第三要求种蛋的外形呈卵圆形，纵径16-17厘米，横径13-14厘米，过长、过圆、扁形及畸形蛋孵化率低。种蛋的颜色一般为乳白色或米黄色。洁白色的蛋孵化率较低。 

　　(3)种蛋保存 种蛋贮存时应大头朝上垂直或倾斜放置，时间以3-5天为宜，如果贮存期不超过7天，可不翻蛋。若种蛋贮存不超过4天，保存温度以16-18℃为宜；超过4天应为13℃左右。相对湿度为60%。 

　　(4)种蛋消毒 鸵鸟蛋从母体产出时会被泄殖腔排泄物污染而附着细菌，随着时间的推移，细菌大量繁殖并通过蛋壳上的气孔进入蛋内，对种蛋的孵化有影响。因此，必须对种蛋进行严格的消毒。种蛋消毒方法较多，一般以甲醛熏蒸消毒法常用。方法是将种蛋放在储蛋室或消毒柜内，按每立方米空间用甲醛溶液(福尔马林)30毫升、15克的剂量，在温度20-25℃的条件下密闭熏蒸20分钟。使用这种方法要注意，甲醛与反应剧烈，又具有很大的腐蚀性。所以，要用容积较大的陶瓷容器，先加入少量温水，投入，再加入甲醛。20分钟以后要及时排出消毒柜中的烟雾，待种蛋的温度逐渐降至18℃时，转入贮蛋柜中或入孵化器进行孵化。