微波熟食杀菌设备主要有：袋装熟食杀菌、罐装熟食杀菌、瓶装熟食杀菌。微波熟食杀菌设备杀菌具有杀菌时间短、速度快、不改变原有风味等特点。
微波杀菌的原理：
微波设备在对食品进行杀菌时，微波能与食品内的细菌发生作用，对细菌膜断面的电位分布影响细胞膜周围电子和离子浓度，从而改变细胞膜的通透性能，细菌因此营养不良，不能正常新陈代谢，生长发育受阻碍死亡。从生化角度来看，细菌正常生长和繁殖的核酸（）和脱氧核酸（DNA）是由若干氢键紧密连接而成的卷曲大分子，微波导致氢键松弛、断裂和重组，从而诱发遗传基因或染色体畸变，甚至断裂。微波杀菌正是利用电磁场效应和生物效应起到对微生物的杀灭作用。