睡莲的种植方法多采用分株种植。耐寒种通常在早春发芽前3-4月进行分株，不耐寒种对气温和水温的要求高，因此要到5月中旬前后才能进行分株。分株时先将睡莲根茎挖出，挑选有饱满新芽的根茎，切成8~10cm长的根段，每根段至少带1个芽，然后进行栽植。顶芽朝上埋入表土中，覆土的深度以植株芽眼与土面相平为宜，确保睡莲不会浮出水面。种植前期水位不易太深，30厘米左右即可，这样有利提高水温；等到发芽后再逐渐提高水位。
睡莲的种植密度不是固定的，根据种植密度和种植品种株型大小而定。以观赏为目的的种植，要求让品种能充分展现它的特征，其花、叶能自然舒展在水面上让人们能欣赏到睡莲花的芬芳和叶片的优雅。这种情况下，我们不要种植密度过大，防止叶片相互重叠簇立出水面。建议每亩种植800棵。