辐照灭菌电子加速器产生的电子束射线具有很强的穿透力，能透过包装直接作用于大肠菌、沙门氏菌、霉菌等细菌，直接杀死细菌，去除水产品、瓜果蔬菜粮食及制品中霉菌、黄曲霉毒素、伏马菌素等生物毒素杀灭微生物和致病菌，减少腐烂，防止微生物污染所造成的食源性中毒事件的发生，不仅可以杀灭90%以上的细菌微生物，降解虾仁等中残留的霉素，就算有存活的微生物，也会因为染色体被电子束打断而无法繁殖从而大大延长贮存期 ；马铃薯、大蒜等辐照还可以抑制发芽；风干食品的辐照除有效的灭菌之外还可以防虫。大部分的食品、保健品、农副产品都可以采用辐照的办法达到消毒灭菌、防霉、杀虫、抑制发芽、推迟成熟、延长保质期的目的。