首先企业要有符合法律法规的证明，如：三同时、环评报告、守法证明等等，这是能申请认证的前提。认证机构会在接到申请方的正式申请书之后，将对申请方的申请文件进行初步的审查，如果符合申请要求，与其签订管理体系审核/注册合同，确定受理其申请。
二：体系建立、运行阶段，直接找咨询培训机构或者咨询老师来协助企业做好ISO14000体系，申请方需要按照认证标准要求和组织自己的环境管理活动实际需要来编写管理手册、程序文件等体系文件。认证机构在审核过程中，若发现申请方的EMS体系文件不符合要求，则会要求组织采取有效纠正措施直至符合要求，并不断改进。
认证阶段，先申请，然后审核老师进场进行认证审核。 申请方接到审核计划之后，如果对审核计划的某些条款或安排有不同意见，立即通知审核组长或认证机构，并在现场审核前解决好这些问题。解决好这些问题之后，审核组正式实施现场审核，主要目的就是通过对申请方进行现场实地考察，验证管理手册、程序文件和作业指导书等一系列文件的实际执行情况，从而来评价该环境管理体系运行的有效性，判别申请方建立的体系和ISO14001标准是否相符合。
三：根据注册材料上报清单的要求，审核组长对上报材料进行整理并填写注册推荐表，该表最后上交认证机构进行复审，如果合格，认证机构将编制并发放证书，将该申请方列入获证目录。